Todos los restos gruesos se filtran del agua mediante un separador. Se bombea continuamente una corriente parcial sobre el separador y después el agua vuelve al depósito por la perforación más pequeña. Los restos de menor tamaño, como trocitos de hojas, tallos, madera, etc. se quedan en el separador de donde salen luego y pueden recogerse como residuos. Así se evita dañar la fruta y que se obstruyan o averíen las máquinas durante todo el proceso.